Fanny y Alexander son hijos de Óscar y Emilie. Su abuela paterna es dueña de un teatro, en donde su padre es el director; ahí viven felices y se divierten actuando, hasta que inesperadamente su padre muere durante el ensayo de una obra.

Después de enviudar, su madre deja todo en manos del obispo Edvard Vergérus, quien la convence de iniciar una relación con él e irse a vivir juntos. Los niños se niegan a irse, pero son obligados por Emilie. En su nueva casa, Alexander comenta que vio a las hijas muertas del religioso y le confesaron que fueron asesinadas por él. Esto enoja tanto al pastor que encierra al niño en un cuarto sin luz.