Hajime Kindaichi es un joven estudiante de preparatoria vago, impuntual y mal estudiante, sin embargo, posee una enorme inteligencia, tiene un coeficiente intelectual de 180 y una capacidad inusual de deducción. Junto con su amiga de la infancia y compañera de estudios Miyuki Nanase, ayudará a la policía en la resolución de los casos más difíciles, trágicos y enigmáticos.