Se organizó el cuadro general de materias en función de tres líneas de conocimiento relacionadas, que obedecen a la evidencia del cine como industria, como arte y como realidad tecnológica.

Se estableció desde entonces el programa de estudios en cuatroaños, dirigido a la formación en realización cinematográfica. A partirdel segundo año los estudiantes pueden optar, además, por una especialidad en las áreas de fotografía, producción, edición o sonido.

Al término de los cuatro años se realizan las películas de tesis, que son las primeras obras profesionales de los estudiantes del ccc. Se ha dado especial importancia al ciclo de cine documental a partir de la firme creencia en la necesidad de fomentar en los jóvenes una mirada propia sobre la realidad social que les rodea.

Las características de los estudios determinaron, desde el comienzo del ccc, que los grupos fueran reducidos. Esto obedece a la necesidad de ejercer una enseñanza que atienda al desarrollo creativo de cada alumno. La capacitación que se imparte, al no ser meramente teórica sino también práctica, conlleva las limitantes en la infraestructura tecnológica disponible que restringen el grado óptimo de aprendizaje a un corto número de alumnos.

El curso de guión cinematográfico se volvió a impulsar desde 1997 como parte de una necesidad de ampliación de la oferta académica de la escuela. Consta de dos años de duración (de tiempo parcial) y cuyo resultado final es la escritura de un guión de largometraje.

Debido a la inserción del ccc en el Centro Nacional de las Artes, se ampliaron las tareas interdisciplinarias con los centros de investigación y las escuelas por medio de programas que incorporaron la docencia, la investigación y la difusión artística.

El surgimiento del Programa de Apoyo a la Docencia, Investigación y Difusión de las Artes (padid) del Centro Nacional de las Artes en 1994, resultó de crucial importancia para apoyar los esfuerzos del ccc en el sentido de obtener excelencia en diversas actividades.