Propuesta de un modelo teórico para la antropología del comportamiento (época colonial).

Epistemología del cuerpo en la antropología física.

Los esclavos negros y sus descendientes en el ingenio de San Nicolás de Ayotla, Oaxaca.

Parentesco biológico en el México prehispánico.

Evidencias de sacrificio humano y canibalismo en restos óseos.

Salud y nutrición en poblaciones antiguas de México.

Una estrategia bioarqueológica para el análisis del resto óseo modificado. El caso de Cantona, Puebla.

Dinámica de la zona indígena centro-occidente de Michoacán. Población, jerarquía de las localidades y recursos naturales en una perspectiva regional.

Este proyecto, de carácter multidisciplinario e interinstitucional, contempló estudios en 90 localidades pertenecientes a 25 municipios del occidente de México. Dentro de esta disciplina se impulsó la conservación y catalogación de colecciones óseas en todo el territorio nacional.

La Dirección de Etnohistoria desarrolló proyectos de investigación sobre códices, historia regional, grupos étnicos del periodo colonial, ediciones críticas y fuentes pictográficas. Por su importancia destacan los siguientes proyectos:

Edición crítica de las obras de Robert H. Barlow.

La provincia tributaria de Jilotepec.

Edición de códices mesoamericanos.

Aculturación y conquista en Oaxaca.

Diario de Chimalpáhin.

Las especialidades de etnología y antropología social trabajaron en proyectos de investigación sobre diversos grupos étnicos y sociales, cultura e identidad, religión, medicina tradicional, sistemas políticos, fronteras y recuperación del patrimonio cultural intangible.